MG_064 – ABC transporter, permease protein, putative

Name
WID MG_064 View in model
Name ABC transporter, permease protein, putative View in model
Protein product MG_064_MONOMER
Cross references GenBank: AAC71282.1, CMR: MG_064, BioCyc: MG_064, SwissProt: P47310
Homologs
 
Classification
Type mRNA View in model
 
Structure
Structure 7119080186 MG_062 MG_063 MG_064 MG_065 MG_066 View in model
Sequence Chromosome: Mgenitalium_Chr_1, Coordinate: 73690 (nt), Length: 3996 (nt), Direction: Forward, G/C content: 29.7%, Sequence:
1
51
101
151
201
251
301
351
401
451
501
551
601
651
701
751
801
851
901
951
1001
1051
1101
1151
1201
1251
1301
1351
1401
1451
1501
1551
1601
1651
1701
1751
1801
1851
1901
1951
2001
2051
2101
2151
2201
2251
2301
2351
2401
2451
2501
2551
2601
2651
2701
2751
2801
2851
2901
2951
3001
3051
3101
3151
3201
3251
3301
3351
3401
3451
3501
3551
3601
3651
3701
3751
3801
3851
3901
3951
GTGTTAAACCTAATTAAAAATGTTATTCGTTCTTTAAAGAGTGCTAAGAT
TGCTTTAATAGCGTTAACTTTTTTAATTTTTGTTGCTGTTGGTGGTTTTG
TGTTGTTAAATAACACAGTTAATAATTTTAACGCTGCTTTTAACTATGTC
ACCCACACTGGTAAATTAAGCAATGCCATCATTAATGAGCGTTATGACTT
TGGTAAATTAGAGTTTCAAGAACAGACCAATAATTCTCAGAATAGTAGCG
ACAGTTTTACTTTAACTTTAACTAATGATTCAAGAACAAGTTTTATTAAT
AATGCCTTGAGAACTAACCCTTCTTTGTATGAAGGATTAGTAACCCAAAC
TTTTAGCTATCAAAACAAAACTGAAATGACTGAAAAAACCAATATAGTTA
ATCAGTCTAAAATTATTGCTGCTAACAATCTTAACAATGCATTAAGTAAA
GATAAACAGCTCTTAGTTTCAGGTCAACTTGAAAAACTAAATGCTGTTTT
TCGGGAATATAAAGCTATTAATATTACTGACAAAAGTGTTTTTAAAAAAT
TGATAGTATCAGAACCTAATGATTTGGTAAATAGCCTAGTTATTTTTGAT
GGTCAAAATTTATCTAGCTCCAAACAAAGTGATTTCAATAATTTTTTAAA
TCAATTTAACGAAATTAAATCAAAGGGTAAAGATAATTTAAGTACTACTT
TAAAAACTGGGCAGTATCAGGCATTTTTACAAACTCTTTTTGATTATGCT
CAAGCGAGTGAAACAACATTAAAAGATCAGCTTCAAAAGTTAATTTCAAA
TCCAGATTCAAGTGAAACAAATCAGGTTAAAAATCTCTTTGATACTCCAA
GTACGCTTACTAATATTGGGGGTCAATTAACCTTACAATGAACAGAAAAT
AGCCTAACAAAACAGATAGTTATCTTTGATCCTAGTAGTTATGAAACAAT
AGTCGCTCCTGGTAACTGAACTTATCAACAACAATTAGGTAAAGAAGTTT
ATCCTGATATTAACAACTGAGAAAGTATTAAAAAACTACCACTTGAACAA
TTTGAAAGTGAATTTTTAAAAATTGATCAAAAGTATAAGATCAGTATTGA
TAATATCGATTATTTAGTTATTGGGGTTGGAATTAGTCCAGATTTTGTTT
ATCCTGTTTTTAGTGCATCTTTAATTGTTCCTAACATTGAAAATGAACAA
CTTTACTATGTTAACCAAACTGGATATGAAAGAACTTTTTCCTCTTTTTT
AACAAATCCAGTTGAAACAGCAATAGTAGCAAGATTGATTAATCTTGAAA
GTGATCTTAATACTATCAACCAGTGAGCTGTTGAAAACATGTCATGACCA
ACAAACATTAAAGCTGCATACAGTAGTTCTGATACCACTAATATTTTGAA
TTTATTAGCAGCAAGAACAGTTTTTATCCCTAATCTAATTAACACAATTA
ATTTAGTGGCTTTGTTTTTAACTATTGCTATCCTAACTGTTGCTATAATT
GTCAGCATTTTAATCCTGATTAGTTATTTAAAGAAAAACACTGAGCAAAT
TGGCATTTTAAAAGCAAATGGGTTAAGTGGTAAAAAGATTAACCTTAGCT
TGTTAATCTTTGGGTTAATTCCTGCTATAGTAGGTGCTATTTCTGGATAT
AGCTTTGGAATTGGATTTCAAGACGTAGCTATTCATCTATTTAGTAACTA
TTGATTTATACCAACAGCAACATCAAGTTTTTCAGTAGTAGGATTGTTGT
TTTTTTCACTGTTTGTTATCTTAATTATGAGTAGTATATCGCTTTTAGTG
GGATCAATTATCTTAAAGAAGGATGTTGTAAAGATTTTAAAGCATGACAG
TGAATTTAAAGTTTCAAGATTAGGACTTAGTTCTAAGAAATTGTTTGCTA
GGTTTGGTATTATGACCAGGTTTAGAGTAGCATTAGCATTTAACGCTCCT
TGAAAATTAGTTTTTCTAACCTTGATGAGTTCATTTACAATGATGATTTT
AAACCTTAGTTTTGCAACTAAAGATAGCTTTGAAAATGCTCAATCAAAAA
CTAATTTAACTAATCAGAACCACCAATATGAATTTGAACTCGCTTCAGCA
ACAACACAAAGTGGTTTATTGAAGTGACAGTTATTTGCAGAACTAGGTAC
AACTGATAAAAGAAGTGAAAGTAGTGTAAAGCTTGCAAATAAAAGGATGG
ATATTAGTAATGTTGATGCATCTAAAGATTGAAAGAACCAACAAGTAATT
AATTTTTTAAGCGATGCTAGTGGCTTTAGTAATGATTTAAATTACCTTGA
AAACATTGTTCAATCCAAGATAGGTTTAGACTATTCATTGGGATTTAACA
ATATTGTTTCAAATCCCTGAAGGTTAAGTGAAACATTAATGCCAACTAAC
CAAGCATCTGCTTCCAACACTGCTTTTCAAAATTTTTTAAAAGCAATCAT
TACTATAAATCCAAGCCAAGGATCGCAATTCATTAAACAAACCCAAGATC
CATTAACAAAAAGATTTATCTATGCAATTGACAGTGATAAGGCATTAAAA
AATAATAATGAACAAAACGGTTCCCAAAACCACTTAACTTTAAATGATGA
TTTTGCTAAATTTCTCTACAGTCAATTTGAATTAATTAAAAAGAGTGGGA
ATGCAAGTAATGAAGATTTAAATGCAATTGATTTTGAAAACCCCCAAACA
ATCAGAGATTTTTACAACAAGTACAATGCTTTACCACCATTAGATTACAA
ACTTAGCTTTAATGTAATAGGTTTACCCAAAGAGACAATTGCTGGACAAA
TTGACACCCCTAAGTATGGATTTTTAACCCTTCATGGTGAATATCAAAAT
ACTCCTATCAAGATTAAAGGTATTAAAGATTGAAAAGATAAAGTGGATAA
TTTAGGTCCAGTTTTGAGTGATCAAAACAACCACATTATTAATCAAGAAT
TGTTTAAAAATTATTCTTTTGATCCTTTGATAGTTAACAATTCTGCTGCA
AAAAAATACCAACTTGCAATAGGTAGTGAGATTAATATTGCAGTTAACAA
CAGCTTCAAACGGATTGACAATAAGATCATTAATCAAGATCCTTTAGTGA
ATGCTACCTTTAGAGTTGTAGGGATTAACAATTCCGCTCATGATCCTGAA
TTTTTCACTAGTTATAGTACTGCTTTTAAAGTATTGGAATATCCCAATGA
ATGGTTCGTAAAAAAACTTCCATTTAATAGCTTCTATGCTAATTCGCTTT
TAAGTTTTGTTCAATCTACTTCGCTATTTTCTGAATCTGGTATTTTTCCT
GCTACTAGTAGTTTTTCAACTAATAACACTGTACTTGTTGAGTTAATTAA
AAAAACCATTAATTACAAGAATGGTCAAATGAATCAAACTTCAAGTAATG
ACTCTTCTAAGAAAGAAAATTACCAAAAATTGCAAAAAGCATTAGGAATA
TCAACTGATTTGGAGATTAGTAAAGTTAATGAATATGTTGCTATCTTAGC
AAGGGTTTATAATGGTTTACCTTACAACTCTACTATTAGCTTTATTAGCA
ATGTTGCTGCTAACAACGCTTTATTTGGAAATATTGCTAACACCACCAAG
CAGATTCAAGCTGTTGTAATTGCAGTGATTATTCCTATAATCATGTTGAT
TATTCTTTTGGTTTCAACTACCTTAATTCAAGAGTTGAAAAAAATTGCTA
TTAGATTAAAAGCATTGGGATATTCCAATTTAAAAATTCTCGCTTCATTT
TTATCAATATACATCCCTTTATTTGCCTTTGGTTTGTTGATTTCTATCCC
CTTTTCTATCTATCTAATTGCACTACATAATGAGGTAATTTTTGCAAGCT
CATCGATCTTTTTAGATGCTTTTTTAAGTTTTGAAAGTGCAATTGGTTCA
ATGTTAGTTTTACTAGCGGTTTTATCAATTACCTTTGTGTTGAATTGATT
AGAGTTGAACAAAATTAAGATTGACAAGGAAATCAAAAACTCCTAA
50
100
150
200
250
300
350
400
450
500
550
600
650
700
750
800
850
900
950
1000
1050
1100
1150
1200
1250
1300
1350
1400
1450
1500
1550
1600
1650
1700
1750
1800
1850
1900
1950
2000
2050
2100
2150
2200
2250
2300
2350
2400
2450
2500
2550
2600
2650
2700
2750
2800
2850
2900
2950
3000
3050
3100
3150
3200
3250
3300
3350
3400
3450
3500
3550
3600
3650
3700
3750
3800
3850
3900
3950
3996
View in model
Transcription unit TU_040 View in model
Empirical formula (pH 7.5) H42575C38578N15834O27928P3996
Molecular weight (pH 7.5; Da) 1298644.76 View in model
 
Functional genomics
Is essential
Yes (Show evidence)
View in model
Relative expression
1.96428 (dimensionless) (Show evidence)
View in model
Half life
4.425 (min) (Show evidence)
View in model
Extinction coefficient 
(260 nm, 25C, pH 7.0)
41449300
pI 4.08
 
Comments
Comments no predicted substrate binding protein in M. genitalium; macrolide-specific ABC transporter [PUB_0110];
References
  1. Bernstein JA, Khodursky AB, Lin PH, Lin-Chao S, Cohen SN. Global analysis of mRNA decay and abundance in Escherichia coli at single-gene resolution using two-color fluorescent DNA microarrays. Proc Natl Acad Sci U S A 99, 9697-702 (2002). WholeCell: PUB_0602, PubMed: 12119387

  2. Chen J, Anderson JB, DeWeese-Scott C, Fedorova ND, Geer LY, He S, Hurwitz DI, Jackson JD, Jacobs AR, Lanczycki CJ, Liebert CA, Liu C, Madej T, Marchler-Bauer A, Marchler GH, Mazumder R, Nikolskaya AN, Rao BS, Panchenko AR, Shoemaker BA, Simonyan V, Song JS, Thiessen PA, Vasudevan S, Wang Y, Yamashita RA, Yin JJ, Bryant SH. MMDB: Entrez's 3D-structure database. Nucleic Acids Res 31, 474-7 (2003). WholeCell: PUB_0110, PubMed: 12520055, URL: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/

  3. Glass JI, Assad-Garcia N, Alperovich N, Yooseph S, Lewis MR, Maruf M, Hutchison CA 3rd, Smith HO, Venter JC. Essential genes of a minimal bacterium. Proc Natl Acad Sci U S A 103, 425-30 (2006). WholeCell: PUB_0193, PubMed: 16407165

  4. Weiner J 3rd, Zimmerman CU, Göhlmann HW, Herrmann R. Transcription profiles of the bacterium Mycoplasma pneumoniae grown at different temperatures. Nucleic Acids Res 31, 6306-20 (2003). WholeCell: PUB_0569, PubMed: 14576319

 
Metadata
Created 2012-10-01 15:07:12
Last updated 2012-10-01 15:12:47